Arthrobacter, Si bakteri Bioremedasi

Arthrobacter (dari bahasa Yunani, "tongkat kecil bersendi") adalah genus dari bakteri yang umumnya ditemukan di dalam tanah. Semua spesies dalam genus ini adalah bakteri Gram-positif obligat aerob yang dimana motilitas mereka pada awalnya ditemukan untuk dihubungkan dengan siklus morphogenic yang berbeda dari tiga spesies Arthrobacter: Arthrobacter atrocyaneus, Arthrobacter citreus, dan Arthrobacter simplex. Motilitas awal pada saat induksi untuk morfologi berbentuk batang, namun yang kemudian non-motil ketika di morfologi coccoid (Stanlake dan Clark, 1976).

Spesies Arthrobacter telah sangat berguna dalam bioremediasi tanah yang terkontaminasi dengan pestisida dan herbisida; Hal ini dimungkinkan karena genom mereka beradaptasi, yang dapat menangani stres kondisi dan lingkungan (Mongodin et al., 2006). Arthrobacter adalah bakteri dasar tanah, tetapi telah ditemukan untuk melakukan beberapa fungsi penting untuk menghilangkan racun bumi dengan berbagai bahan kimia jahat. Baru-baru ini, telah ditemukan bahwa beberapa spesies dari Arthrobacter dapat mengurangi Kromium heksavalen, yang dapat menyebabkan iritasi yang parah pada manusia dan mereka juga dikenal berfungsi untuk menurunkan pestisida pada pertanian.

 Spesies Arthrobacter pertama kali ditemukan dalam tanah di abad ke-19 dan sejak menetapkan diri sebagai salah satu genus bakteri yang dominan ditemukan di dalam tanah. Genus Arthrobacter  telah menunjukkan bahwa mereka memiliki akal metabolik karena kemampuannya untuk tumbuh di berbagai jenis substrat. Genus ini tidak hanya berakal metabolik, tetapi juga tahan terhadap kondisi lingkungan yang tidak diinginkan Arthrobacter telah ditemukan untuk bertahan hidup di tempat-tempat seperti permukaan dalam, es Arktik, lokasi yang terkontaminasi kimia dan lingkungan radioaktif. Mereka dapat menangani kelaparan, radiasi, paparan radikal oksigen dan bahkan bahan kimia beracun. Kemampuan ini luar biasa untuk bertahan hidup telah dikaitkan dengan siklus morfologi unik Arthrobacter, yang memungkinkan spesies untuk tetap di kondisi yang stabil, konfigurasi coccoid pada waktu stres (Mongodin et al., 2006). Hal ini juga penting untuk mengetahui bahwa spesies Arthrobacter memiliki suhu pertumbuhan optimal antara 20 dan 30 C. netral pH sedikit basa juga disukai untuk pertumbuhan (Holt et al., 1994).

Karakteristik spesies Arthrobacter sedang digambarkan oleh HJ Conn pada awal 1928, tapi tidak sampai 1957 bahwa genus Arthrobacter dimasukkan sebagai bagian dari keluarga Corynebac teriaceae (Breed et al., 1957).  Fitur yang membedakan utama untuk spesies Arthrobacter adalah cara spesies bisa bergantian antara batang dalam budaya muda dan coccoids dalam budaya yang lebih tua. Ketergantungan pada karakteristik morfologi pasti menyebabkan kebingungan atas apa yang sebenarnya merupakan anggota dari genus dan menyebabkan banyak misclassifications spesies. Seiring waktu, karakteristik yang lebih dituangkan sebagai diperlukan untuk dimasukkan sebagai anggota dari genus Arthrobacter, dan dua kelompok, dimana semua spesies harus diklasifikasikan dalam, dikembangkan. Kelompok-kelompok ini adalah A. globiformis / A. kelompok citreus dan kelompok A. nicotianae, dan mereka berbeda dalam tiga bidang penting termasuk konstruksi mereka peptidoglikan, kandungan asam teichoic, dan komposisi lipid (Jones dan Keddie, 2007).

Didasarkan dari hasil 16s rRNA studi, spesies Arthrobacter terkait dengan genera coryneform berikut:  Aureobacterium, Cellulomonas, Curtobacterium dan Microbacterium spesies Arthrobacter juga terkait, meskipun kurang erat, untuk Brevibacterium (Stackebrandt et al, 1980). Mereka semua tampil di cabang actinomycete pohon filogenetik untuk gram positif Eubacteria dengan konten GC tinggi. Selain itu, spesies  Arthrobacter ini tidak dapat dipisahkan filogenetis dari anggota genus  Micrococcus karena kesamaan.Namun, baik  Arthrobacter dan Micrococcus dianggap taksa mereka sendiri (Jones dan Keddie, 2007).

References: 

Conn, H. J., & Dimmick, I. (1947). Soil bacteria similar in morphology to Mycobacterium and Corynebacterium. N.Y. State Agricultural Experiment Station, 54(1): 291–303.

Holt, John G., N.R. Krieg, P.H.A. Sneath, J.T. Staley, and S.T. Williams. (1994). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Ninth Edition. 787 pp, Baltimore, Maryland: Williams & Wilkins.

Jones, D., & Keddie, R. M. Arthrobacter sp. FB24 - Home. The Prokaryotes [electronic resource]. Retrieved September 22, 2012, from http://genome.jgi-psf.org/art_f/art_f.home.html

Jones, D., & Keddie, R. M. (2007). The Prokaryotes. (M. Dworkin, S. Falkow, E. Rosenberg, K.-H. Schleifer, & E. Stackebrandt, Eds.) (pp. 945–960). Springer New York. doi:10.1007/0-387-30743-5

Mongodin, E. F., Shapir, N., Daugherty, S. C., DeBoy, R. T., Emerson, J. B., Shvartzbeyn, A., Radune, D., et al. (2006). Secrets of soil survival revealed by the genome sequence of Arthrobacter aurescens TC1. PLoS genetics, 2(12): e214. doi:10.1371/journal.pgen.0020214

Stanlake, G. J., & Clark, J. B. (1976). Motility as a morphogenic character in the genus Arthrobacter. Journal of Bacteriology, 127(3), 1524–8. Retrieved from http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=232948&tool=pmcentrez&rendertype=abstract

Stevenson, I. L. (1967). Utilization of Aromatic Hydrocarbons by Arthrobacter spp. Canadian Journal of Microbiology, 13(2): 205–211. doi:10.1139/m67-027

http://www.edulifedesks.org/class/2716/taxon-page/2777